MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 22957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021898	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021898	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021898	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021898	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021898	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021898	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021898	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021898	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021898	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021898	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021898	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021898	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021898	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021898	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021898	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021898	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021898	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021898	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021898	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021898	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021898	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021898	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021898	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021898	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021898	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021898	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021898	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021898	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327368
29	NC_021898	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327368
30	NC_021898	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327368
31	NC_021898	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327368
32	NC_021898	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	527327368
33	NC_021898	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327368
34	NC_021898	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327368
35	NC_021898	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327368
36	NC_021898	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327368
37	NC_021898	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527327368
38	NC_021898	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327368
39	NC_021898	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327368
40	NC_021898	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021898	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021898	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021898	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021898	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021898	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021898	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327369
47	NC_021898	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327369
48	NC_021898	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327369
49	NC_021898	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527327369
50	NC_021898	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527327369
51	NC_021898	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327369
52	NC_021898	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327369
53	NC_021898	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327369
54	NC_021898	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327369
55	NC_021898	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527327370
56	NC_021898	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327370
57	NC_021898	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527327370
58	NC_021898	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327370
59	NC_021898	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327370
60	NC_021898	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327370
61	NC_021898	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327370
62	NC_021898	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327370
63	NC_021898	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
64	NC_021898	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327370
65	NC_021898	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
66	NC_021898	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327370
67	NC_021898	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327370
68	NC_021898	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527327370
69	NC_021898	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	527327370
70	NC_021898	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
71	NC_021898	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327370
72	NC_021898	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327370
73	NC_021898	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527327370
74	NC_021898	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
75	NC_021898	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
76	NC_021898	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
77	NC_021898	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327370
78	NC_021898	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527327370
79	NC_021898	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527327370
80	NC_021898	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
81	NC_021898	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
82	NC_021898	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327370
83	NC_021898	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327370
84	NC_021898	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527327371
85	NC_021898	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327371
86	NC_021898	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327371
87	NC_021898	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527327371
88	NC_021898	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327371
89	NC_021898	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527327371
90	NC_021898	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327371
91	NC_021898	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527327371
92	NC_021898	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327371
93	NC_021898	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327371
94	NC_021898	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	527327371
95	NC_021898	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327371
96	NC_021898	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527327371
97	NC_021898	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	527327371
98	NC_021898	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327371
99	NC_021898	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527327371
100	NC_021898	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527327371
101	NC_021898	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327371
102	NC_021898	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327371
103	NC_021898	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327371
104	NC_021898	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327371
105	NC_021898	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327371
106	NC_021898	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527327371
107	NC_021898	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327371
108	NC_021898	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527327371
109	NC_021898	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527327371
110	NC_021898	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327371
111	NC_021898	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327371
112	NC_021898	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021898	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021898	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021898	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327372
116	NC_021898	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327372
117	NC_021898	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327372
118	NC_021898	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527327372
119	NC_021898	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327372
120	NC_021898	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527327372
121	NC_021898	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527327372
122	NC_021898	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327372
123	NC_021898	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
124	NC_021898	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527327372
125	NC_021898	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527327372
126	NC_021898	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
127	NC_021898	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327372
128	NC_021898	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
129	NC_021898	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327372
130	NC_021898	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
131	NC_021898	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327372
132	NC_021898	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527327372
133	NC_021898	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527327372
134	NC_021898	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	527327372
135	NC_021898	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327372
136	NC_021898	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327372
137	NC_021898	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527327372
138	NC_021898	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327372
139	NC_021898	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327372
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398	NC_021898	AGG	2	6	17977	17982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327384
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